增值税专用发票丢失，是件令人感到十分头疼的事情。那么增值税专用发票丢失了该怎么办呢?本文就不同情况下增值税专用发票丢失的处理办法进行了系统梳理，下面一起来看一下。
情况一：快递公司丢失
因为目前快递丢失，快递公司可能不承担责任的，则需要由销售方和购买方双方协商，看哪一方去处理相关事宜。
A、协商是销售方承担责任的：需要销售方先在报纸上刊登“遗失声明”，然后携带：丢失情况说明书(加盖公司公章)、登报报纸、记账联复印件(加盖公章)、至主管国税局接受处罚，然后税局开具《已报税证明单》，销售方需把税局开具《已报税证明单》、记账联复印件给购货方作为抵扣凭证。
B、协商是购买方承担责任的：需要购买方先在报纸上刊登“遗失声明”，然后至主管国税接受处罚，然后把写好的丢失情况说明书给销售方，销售方携带：购买方登报报纸、丢失说明书、记账联复印件至主管税务局开具《已报税证明单》，然后销售方把《已报税证明单》和记账联复印件给购买方认证抵扣。
情况二：销售方丢失
丢失发票联和抵扣联
销售方首先先在报纸上刊登“遗失声明”然后携带自己写好的丢失情况说明书(加盖公章)、记账联复印件(加盖公章)去税局接受罚款，同时开具《已报税证明单》，销售方然后把税局开具《已报税证明单》、记账联复印件给购货方作为抵扣凭证。
丢失发票联
购买方以抵扣联作为记账凭证，抵扣联复印件留存备查
丢失抵扣联
购买方用发票联认证，复印件留存备查
情况三：购买方丢失
丢失发票联和抵扣联
税务上：首先购买方先在报纸上刊登“遗失声明”，然后去税务局接受罚款，然后受票方写一份丢失发票情况说明书(加盖公章)然后把说明书交给销售方，再由销售方携带购买方写好的丢失情况说明书(加盖购买方公章)、记账联复印件(加盖销售方公章)开具《已报税证明单》
财务上：丢失前已认证，凭借记账联复印件及销售方主管税务机关开具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。
丢失前未认证，凭借销售方提供记账联复印件认证，记账联复印件及《已报税证明单》作为抵扣凭证，销售方需把税局开具《已报税证明单》、记账联复印件给购货方作为抵扣凭证。
丢失发票联
抵扣联作为记账凭证，抵扣联复印件留存备查
丢失抵扣联
丢失前已认证，用发票联复印件留存备查，丢失前未认证，用发票联认证，复印件留存备查。
政策依据：
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》
《国家税务总局关于简化增值税发票领用和使用程序有关问题的公告》(国家税务总局公告2014年第19号)第三条
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