厘清加计扣除、限额扣除部分
(一)安置残疾人就业加计扣除
1.扣除依据。根据《企业所得税法》第三十条，安置残疾人员及国家鼓励安置的其他就业人员所支付的工资，可以在计算应纳税所得额时加计扣除。
2.判定原则。根据《财政部、国家税务总局关于安置残疾人员就业有关企业所得税优惠政策问题的通知》(财税〔2009〕70号)第三条规定，判断企业享受安置残疾职工工资100%加计扣除的条件。
3.加计扣除范围。残疾人员范围，应适用《残疾人保障法》的有关规定。残疾人员加计扣除范围，应参照国税函〔2009〕3号文件第二条工资薪金总额范围，不等同于企业会计的工资薪酬范围。
(二)职工福利费支出限额扣除
1.扣除依据。根据《企业所得税法实施条例》第四十条规定，企业发生的职工福利费支出，不超过工资、薪金总额14%的部分，准予扣除。
2.扣除范围。根据国税函〔2009〕3号文件第三条规定，《实施条例》第四十条规定的企业职工福利费，包括以下内容：
(1)尚未实行分离办社会职能的企业，其内设福利部门所发生的设备、设施和人员费用，包括职工食堂、职工浴室、理发室、医务所、托儿所、疗养院等集体福利部门的设备、设施及维修保养费用和福利部门工作人员的工资薪金、社会保险费、住房公积金、劳务费等。
(2)为职工卫生保健、生活、住房、交通等所发放的各项补贴和非货币性福利，包括企业向职工发放的因公外地就医费用、未实行医疗统筹企业职工医疗费用、职工供养直系亲属医疗补贴、供暖费补贴、职工防暑降温费、职工困难补贴、救济费、职工食堂经费补贴、职工交通补贴等。
(3)按照其他规定发生的其他职工福利费，包括丧葬补助费、抚恤费、安家费、探亲假路费等。
3.企业发生的职工福利费，应该单独设置账册，准确核算。
案例：2017年，A企业发放职工工资合计1200万元，交通补贴和住房补贴400万元，为高危工作岗位人员提供福利性津贴100万元，上述支出根据企业董事会制定的工资薪金制度按标准定期发放，且A企业依法代扣代缴了个人所得税，符合2015年34号公告第一条规定。企业内设福利部门发生费用100万元，企业为职工发放消暑补贴200万元。此外，企业安置一名残疾人员就业，支付年度工资为10万元，符合财税〔2009〕70号文件有关规定。
解析：交通补贴、住房补贴和为高危工作岗位人员提供福利性津贴，合计500万元，计入“福利性补贴”，同时作为工资薪金支出。企业内设福利部门费用100万元、职工消暑补贴200万元，合计300万元，计入“福利费”，不计入工资薪金总额。
企业在所得税汇算清缴中，可以计入工资总额的费用为1700万元(1200+400+100)，职工福利费扣除限额238万元(1700×14%)，职工福利费支出300万元(200+100)，应调增应纳所得税额62万元(300-238)。企业安置残疾人就业，在计算应纳税所得额时，可据实扣除10万元，再加计扣除10万元。在适用税率为25%的情况下，企业可享受2.5万元税收减免优惠。
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