农村信用合作社，简称“农信社”，指经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。
农村商业银行，简称“农商银行”或“农商行”，是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。
在一些经济发达的地区，农村信用社规模达到一定程度，就会将其进行股份制改革，改制成农商银行。可以说，农商行是农信社的升级版，目前很多农村商业银行都是从信用社发展改制而来，信用社发展一定的阶段，符合一定的条件之后就可以改制成农村商业银行。
二者主要存在以下几点区别：
1、性质不同： 农村商业银行是股份有限公司区域金融机构，农村信用社是股份合作制企业的地方金融机构。
2、发起人不同： (1)农商行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构，目前一般都是由有一定实力的企业发起成立。 (2)而农村信用社是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。
3、管理方式不同： 信用社实行社员民主管理,而农村商业银行以股东大会作为最高管理机构。
4、监管部门不同： 商业银行主要受银监会监管，而信用社作为省联社的发起人却主要受省联社监管。
5、规模实力不同：一般来讲农商银行与农信社相比，农商行规模更大、更具实力。
6、经营模式不同： (1)农村商业银行作为一个整体，以整个银行的盈利为目的，每个分行都会受到总行的直接管理。 (2)而农村信用是在省联的指导下独立运营，每个农信社都是一个独立法人，自负盈亏，省联可以管理和知道信用社的发展，但是不能干涉信用社的业务。
7、服务对象不同： (1)信用社主要为社员提供金融服务,它的服务对象主要是农民，主要服务区域在农村。 (2)而农村商业银行是一种区域性金融机构，它服务的对象比较广，跟其他银行机构是一样的，客户群体可以是农村，也可以是城市，可以使企业也可以是个人。
农商行是农信社的升级版，目前，全国各地农信社改革也如火如荼的进行着。通过股份制改革，产权归属将更加明确，农信社和农商行的发展路线也将更加清晰。
