农村信用合作社指经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。
农村商业银行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。
可以看出，农村信用社和农商行是不一样的，农商行有农信社改制而来，其区别主要是规模不同，组织形式不同，监管方式也不一样。
一、规模上不同
农村信用合作社是经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。农信社是独立的企业法人，以其全部资产对农村信用社债务承担责任，其主要任务是筹集农村闲散资金，为农业、农民和农村经济发展提供金融服务。农信社就是是农商银行的前身，当农信社发展到一定程度，资产规模等达到一定标准，报银保监会审批，经同意之后可以改制为农商银行。农村商业银行行与农村信用社相比一般是规模更大和更具实力的。
二、企业性质不同
农村商业银行是股份有限公司，农村信用社是股份合作制企业。通俗的讲，农信系统是类似于连锁模式，有一个总店(省农信)，还有很多地市级农信社、县级农信，每个农信社都是一个独立法人，自负盈亏。类似于母公司下，有很多子公司，母公司有对子公司只有管理权，但是没有干涉子公司业务的权利，子公司自负盈亏。而农商行的前身一般都是由多家地市级农信社或者县级联社合并改制的。类似于多家小公司合并成了一家大公司。
农信社改制成农商银行，有利于明晰产权关系，在强化资本约束的基础上，激活经营机制，增强抗风险能力，进一步提高信贷资产质量，实现发展速度和稳健程度在更高层次上的平衡;有利于优化经营机制和管理机制，按照绩效挂钩和权责利对等原则进行考核、分配，充分挖掘人力资源潜能;有利于用现代金融经营管理理念指导具体经营工作，进一步促进经营管理水平的提升。
