根据《企业会计准则第16号——政府补助》应用指南(2018)的规定，对于增值税直接减征、免征、出口退税、即征即退、留抵退税，分别采用不同的会计处理。
各类增值税优惠的会计处理
1.增值税即征即退的会计处理。比如软件企业即征即退增值税与企业日常销售密切相关，属于与企业的日常活动相关的政府补助，应计入“其他收益”科目。
例如甲企业销售其自主开发的软件，按照国家有关规定，适用增值税即征即退政策，按16%的税率征收增值税后，对其增值税实际税负超过3%的部分，实行即征即退。甲企业2018年8月纳税申报时，对归属于7月的增值税即征即退提交退税申请，经主管税务机关审核后的退税额为20万元。会计处理如下：
借：银行存款 200000
贷：其他收益 200000
2.增值税减免的会计处理。个别减免税款需要按照政府补助准则进行会计处理。例如，属于一般纳税人的加工型企业，根据税法规定招用自主就业退役士兵并按定额扣减增值税，应当将减征的税额计入当期损益，即借记“应交税费——应交增值税(减免税额)”科目，贷记“其他收益”科目。
3.小微企业免税的会计处理。增值税小规模纳税人月销售额不超过3万元(按季纳税9万元)，享受小微企业暂免征收增值税优惠政策。会计处理应借记“应交税费——应交增值税”科目，贷记“其他收益”科目。
4.增值税先征后返的会计处理。例如某企业生产一种先进的模具产品，按照国家相关规定，适用增值税先征后返政策。2018年1月，该企业实际缴纳增值税额60万元。2018年2月，实际收到返还的增值税额42万元(返还70%)。会计处理如下：
借：银行存款 420000
贷：其他收益 420000
5.增值税留抵退税的会计处理。留抵退税不属于政府补助，不可以计入“其他收益”等科目。目前实务中有两种处理方法：
(1)第一种：
借：银行存款等
贷：应交税费——应交增值税(进项税额转出)
留抵税额是因进项税额大于销项税额所致，通过进项税额转出这种做法，从会计的角度考虑，便于平账。但结合税法其进项税额转出范围，主要是指《增值税暂行条例》第十条规定以及《财政部、国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)第二十七条规定的增值税一般纳税人购进服务、无形资产或者不动产，所列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣的情形，而留抵税额不在税法规定的不得抵扣而要做进项税额转出的范围。因此，第一种处理会计与税法不太协调。
(2)第二种：
借：银行存款等
借：应交税费——应交增值税(进项税额)(红字)
这种借方一红一蓝在会计处理中很常见，用进项税额红字直接冲抵留底的税额，从而规避了税法上进项税额转出的不和谐现象，笔者支持第二种做法。
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